Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P10404 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P10404 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P10404 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P10404 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P10404 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P10404 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P10404 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P10404 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P10404 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P10404 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P10404 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P10404 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P10404 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P10404 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P10404 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P10404 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P10404 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P10404 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P10404 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P10404 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
P10404 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P10404 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P10404 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P10404 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P10404 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P10404 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P10404 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P10404 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P10404 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P10404 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P10404 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P10404 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P10404 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P10404 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P10404 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P10404 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P10404 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P10404 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P10404 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P10404 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms