Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl2P10148 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl2P10148 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl2P10148 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms