Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl1P10146 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms