Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myod1P10085 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Myod1P10085 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myod1P10085 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myod1P10085 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myod1P10085 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myod1P10085 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myod1P10085 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms