Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CatspereP0DP43 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CatspereP0DP43 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CatspereP0DP43 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CatspereP0DP43 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms