Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calm3P0DP28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calm3P0DP28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms