Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3cP0DOY1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3cP0DOY1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms