Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c2P0CW03 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms