Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf1P09925 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf1P09925 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Surf1P09925 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Surf1P09925 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Surf1P09925 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Surf1P09925 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Surf1P09925 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms