Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna9P09235 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms