Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb7P09024 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hoxb7P09024 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hoxb7P09024 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms