Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CfhP06909 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CfhP06909 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CfhP06909 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CfhP06909 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CfhP06909 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CfhP06909 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CfhP06909 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CfhP06909 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CfhP06909 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CfhP06909 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CfhP06909 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CfhP06909 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CfhP06909 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CfhP06909 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CfhP06909 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CfhP06909 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CfhP06909 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CfhP06909 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CfhP06909 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CfhP06909 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CfhP06909 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CfhP06909 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CfhP06909 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CfhP06909 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CfhP06909 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CfhP06909 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CfhP06909 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CfhP06909 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CfhP06909 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CfhP06909 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CfhP06909 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CfhP06909 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CfhP06909 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CfhP06909 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CfhP06909 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CfhP06909 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CfhP06909 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CfhP06909 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CfhP06909 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CfhP06909 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CfhP06909 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CfhP06909 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CfhP06909 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CfhP06909 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CfhP06909 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CfhP06909 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CfhP06909 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CfhP06909 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CfhP06909 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CfhP06909 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CfhP06909 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CfhP06909 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CfhP06909 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CfhP06909 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CfhP06909 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CfhP06909 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CfhP06909 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CfhP06909 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CfhP06909 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CfhP06909 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CfhP06909 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CfhP06909 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CfhP06909 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CfhP06909 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CfhP06909 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CfhP06909 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CfhP06909 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CfhP06909 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CfhP06909 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CfhP06909 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CfhP06909 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CfhP06909 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CfhP06909 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CfhP06909 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CfhP06909 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CfhP06909 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CfhP06909 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CfhP06909 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CfhP06909 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CfhP06909 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CfhP06909 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CfhP06909 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CfhP06909 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CfhP06909 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CfhP06909 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CfhP06909 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CfhP06909 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CfhP06909 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CfhP06909 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CfhP06909 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms