Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06330 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06330 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06330 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06330 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06330 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06330 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06330 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06330 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06330 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06330 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06330 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06330 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06330 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06330 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06330 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06330 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06330 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06330 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06330 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06330 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06330 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06330 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06330 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06330 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06330 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06330 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06330 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06330 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06330 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06330 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06330 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06330 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06330 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms