Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P06323 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P06323 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P06323 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P06323 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
P06323 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06323 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06323 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06323 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06323 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06323 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06323 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06323 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06323 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06323 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P06323 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P06323 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P06323 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P06323 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P06323 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P06323 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P06323 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P06323 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms