Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myl1P05977 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myl1P05977 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myl1P05977 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myl1P05977 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myl1P05977 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myl1P05977 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myl1P05977 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myl1P05977 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myl1P05977 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myl1P05977 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.9 ms