Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Got1P05201 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Got1P05201 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Got1P05201 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Got1P05201 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Got1P05201 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Got1P05201 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Got1P05201 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Got1P05201 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Got1P05201 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Got1P05201 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Got1P05201 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Got1P05201 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Got1P05201 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Got1P05201 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Got1P05201 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Got1P05201 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Got1P05201 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Got1P05201 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Got1P05201 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Got1P05201 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Got1P05201 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Got1P05201 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Got1P05201 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Got1P05201 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Got1P05201 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Got1P05201 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Got1P05201 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Got1P05201 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Got1P05201 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Got1P05201 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Got1P05201 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Got1P05201 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Got1P05201 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Got1P05201 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Got1P05201 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Got1P05201 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Got1P05201 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Got1P05201 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Got1P05201 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Got1P05201 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Got1P05201 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Got1P05201 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Got1P05201 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Got1P05201 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Got1P05201 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Got1P05201 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Got1P05201 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Got1P05201 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Got1P05201 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Got1P05201 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Got1P05201 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Got1P05201 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Got1P05201 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Got1P05201 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Got1P05201 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Got1P05201 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Got1P05201 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Got1P05201 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Got1P05201 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Got1P05201 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Got1P05201 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Got1P05201 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms