Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P04214 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P04214 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P04214 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P04214 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04214 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04214 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
P04214 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04214 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04214 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04214 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04214 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04214 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04214 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P04214 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04214 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04214 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04214 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04214 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04214 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04214 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04214 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04214 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04214 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04214 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04214 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04214 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P04214 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P04214 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P04214 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P04214 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P04214 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P04214 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
P04214 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P04214 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04214 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04214 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04214 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04214 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04214 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P04214 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P04214 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P04214 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P04214 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P04214 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P04214 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P04214 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04214 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04214 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P04214 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04214 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04214 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04214 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04214 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04214 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04214 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04214 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P04214 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04214 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04214 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms