Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Ab1P01921 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Ab1P01921 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms