Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01896 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01896 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01896 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01896 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01896 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01896 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01896 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01896 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01896 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01896 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01896 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01896 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01896 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01896 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01896 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01896 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01896 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01896 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01896 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01896 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01896 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01896 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01896 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms