Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01878 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01878 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01878 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01878 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01878 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01878 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01878 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01878 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01878 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01878 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01878 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01878 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01878 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01878 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01878 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01878 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01878 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01878 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01878 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01878 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01878 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01878 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01878 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01878 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01878 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01878 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01878 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01878 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01878 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01878 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01878 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01878 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01878 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01878 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P01878 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01878 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01878 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01878 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01878 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01878 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01878 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01878 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01878 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01878 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01878 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01878 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01878 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P01878 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P01878 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01878 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01878 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01878 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01878 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P01878 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01878 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01878 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01878 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01878 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms