Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01790 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01790 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01790 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01790 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01790 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01790 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01790 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01790 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01790 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01790 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01790 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01790 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01790 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01790 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01790 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01790 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01790 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01790 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01790 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01790 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01790 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01790 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01790 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01790 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01790 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01790 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01790 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01790 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01790 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01790 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01790 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01790 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01790 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01790 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01790 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01790 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01790 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01790 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01790 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01790 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01790 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01790 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01790 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms