Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P01734 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01734 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01734 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01734 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01734 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01734 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01734 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01734 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01734 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01734 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01734 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01734 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01734 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01734 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01734 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01734 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01734 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01734 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01734 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01734 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01734 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01734 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01734 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01734 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01734 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01734 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01734 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01734 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01734 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01734 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01734 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01734 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01734 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01734 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01734 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01734 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01734 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P01734 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01734 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01734 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01734 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01734 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01734 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01734 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01734 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01734 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01734 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01734 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
P01734 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
P01734 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01734 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01734 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01734 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01734 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01734 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P01734 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01734 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01734 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms