Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01729 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01729 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01729 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01729 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01729 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01729 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01729 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01729 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01729 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01729 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01729 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01729 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms