Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01673 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01673 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01673 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01673 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01673 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01673 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01673 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01673 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01673 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01673 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01673 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01673 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01673 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01673 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01673 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01673 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01673 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01673 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01673 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01673 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01673 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01673 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01673 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01673 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01673 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01673 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01673 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01673 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01673 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01673 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01673 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01673 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01673 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01673 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01673 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01673 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01673 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01673 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01673 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01673 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01673 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01673 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01673 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01673 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01673 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms