Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01652 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01652 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01652 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01652 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01652 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01652 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01652 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01652 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01652 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P01652 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01652 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01652 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01652 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01652 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01652 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01652 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P01652 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01652 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01652 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01652 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01652 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
P01652 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
P01652 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01652 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01652 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01652 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01652 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01652 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01652 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01652 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01652 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01652 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01652 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01652 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01652 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01652 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01652 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01652 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01652 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01652 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01652 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01652 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01652 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01652 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01652 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01652 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01652 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01652 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01652 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P01652 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P01652 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01652 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01652 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01652 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01652 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01652 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01652 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01652 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01652 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01652 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01652 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01652 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01652 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01652 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01652 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01652 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01652 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01652 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01652 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01652 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01652 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01652 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01652 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms