Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01644 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
P01644 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01644 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01644 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P01644 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01644 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01644 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01644 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01644 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01644 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01644 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01644 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01644 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01644 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01644 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01644 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01644 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01644 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01644 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01644 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01644 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01644 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01644 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01644 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01644 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01644 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01644 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P01644 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01644 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01644 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01644 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01644 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01644 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01644 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01644 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01644 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01644 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01644 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01644 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01644 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01644 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01644 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01644 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01644 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01644 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01644 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01644 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01644 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01644 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01644 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01644 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01644 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P01644 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01644 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01644 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01644 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01644 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01644 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01644 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01644 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01644 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01644 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01644 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01644 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P01644 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01644 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01644 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01644 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01644 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01644 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01644 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01644 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01644 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01644 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms