Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp1O89090 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp1O89090 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp1O89090 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp1O89090 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp1O89090 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sp1O89090 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp1O89090 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp1O89090 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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