Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Robo1O89026 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Robo1O89026 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Robo1O89026 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Robo1O89026 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Robo1O89026 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Robo1O89026 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Robo1O89026 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Robo1O89026 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Robo1O89026 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Robo1O89026 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Robo1O89026 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Robo1O89026 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Robo1O89026 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Robo1O89026 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Robo1O89026 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms