Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc6O88978 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms