Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Setdb1O88974 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Setdb1O88974 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setdb1O88974 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms