Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F11rO88792 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F11rO88792 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F11rO88792 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F11rO88792 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F11rO88792 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F11rO88792 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F11rO88792 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F11rO88792 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F11rO88792 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F11rO88792 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F11rO88792 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F11rO88792 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F11rO88792 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F11rO88792 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms