Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc27a3O88561 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc27a3O88561 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a3O88561 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms