Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CntfrO88507 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfrO88507 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms