Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
AurkcO88445 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AurkcO88445 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AurkcO88445 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AurkcO88445 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AurkcO88445 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AurkcO88445 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AurkcO88445 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AurkcO88445 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AurkcO88445 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms