Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nid2O88322 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nid2O88322 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nid2O88322 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nid2O88322 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nid2O88322 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nid2O88322 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nid2O88322 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nid2O88322 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nid2O88322 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nid2O88322 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nid2O88322 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nid2O88322 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nid2O88322 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nid2O88322 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms