Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10509O88255 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms