Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec11aO88200 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec11aO88200 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms