Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtssO70370 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtssO70370 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtssO70370 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtssO70370 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtssO70370 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtssO70370 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CtssO70370 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtssO70370 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtssO70370 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtssO70370 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CtssO70370 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtssO70370 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtssO70370 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtssO70370 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtssO70370 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtssO70370 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtssO70370 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtssO70370 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtssO70370 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtssO70370 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtssO70370 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtssO70370 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtssO70370 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtssO70370 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtssO70370 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtssO70370 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtssO70370 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtssO70370 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtssO70370 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtssO70370 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtssO70370 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtssO70370 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtssO70370 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtssO70370 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtssO70370 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtssO70370 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtssO70370 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtssO70370 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtssO70370 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtssO70370 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtssO70370 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtssO70370 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtssO70370 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtssO70370 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtssO70370 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtssO70370 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtssO70370 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtssO70370 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtssO70370 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtssO70370 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtssO70370 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CtssO70370 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtssO70370 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtssO70370 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtssO70370 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtssO70370 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtssO70370 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtssO70370 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtssO70370 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtssO70370 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtssO70370 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtssO70370 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtssO70370 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CtssO70370 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CtssO70370 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtssO70370 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtssO70370 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtssO70370 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtssO70370 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtssO70370 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtssO70370 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtssO70370 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtssO70370 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms