Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf5O70191 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf5O70191 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf5O70191 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf5O70191 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf5O70191 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf5O70191 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atf5O70191 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atf5O70191 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms