Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3aO70157 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3aO70157 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top3aO70157 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top3aO70157 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Top3aO70157 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3aO70157 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3aO70157 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3aO70157 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3aO70157 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3aO70157 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3aO70157 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top3aO70157 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top3aO70157 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Top3aO70157 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top3aO70157 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top3aO70157 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top3aO70157 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top3aO70157 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3aO70157 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3aO70157 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3aO70157 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top3aO70157 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Top3aO70157 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top3aO70157 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3aO70157 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3aO70157 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3aO70157 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3aO70157 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top3aO70157 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top3aO70157 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top3aO70157 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top3aO70157 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top3aO70157 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top3aO70157 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top3aO70157 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top3aO70157 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Top3aO70157 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms