Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb5O55234 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms