Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtogO55225 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtogO55225 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtogO55225 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OtogO55225 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OtogO55225 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtogO55225 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtogO55225 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OtogO55225 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtogO55225 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtogO55225 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OtogO55225 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtogO55225 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtogO55225 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OtogO55225 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtogO55225 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtogO55225 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtogO55225 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtogO55225 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtogO55225 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OtogO55225 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OtogO55225 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OtogO55225 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OtogO55225 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OtogO55225 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OtogO55225 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OtogO55225 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OtogO55225 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OtogO55225 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OtogO55225 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OtogO55225 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OtogO55225 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OtogO55225 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OtogO55225 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OtogO55225 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OtogO55225 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OtogO55225 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OtogO55225 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OtogO55225 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OtogO55225 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OtogO55225 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtogO55225 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtogO55225 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtogO55225 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtogO55225 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OtogO55225 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtogO55225 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtogO55225 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtogO55225 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtogO55225 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtogO55225 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtogO55225 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OtogO55225 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtogO55225 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OtogO55225 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtogO55225 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtogO55225 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OtogO55225 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtogO55225 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtogO55225 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms