Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PrxO55103 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PrxO55103 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PrxO55103 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrxO55103 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PrxO55103 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PrxO55103 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PrxO55103 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrxO55103 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrxO55103 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrxO55103 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrxO55103 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrxO55103 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PrxO55103 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PrxO55103 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PrxO55103 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PrxO55103 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PrxO55103 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrxO55103 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PrxO55103 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PrxO55103 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PrxO55103 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrxO55103 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrxO55103 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrxO55103 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrxO55103 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrxO55103 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrxO55103 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrxO55103 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrxO55103 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PrxO55103 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PrxO55103 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrxO55103 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrxO55103 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrxO55103 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PrxO55103 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrxO55103 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrxO55103 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrxO55103 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrxO55103 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrxO55103 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrxO55103 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrxO55103 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrxO55103 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrxO55103 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrxO55103 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrxO55103 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrxO55103 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PrxO55103 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrxO55103 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrxO55103 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrxO55103 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PrxO55103 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrxO55103 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PrxO55103 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrxO55103 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrxO55103 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrxO55103 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PrxO55103 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PrxO55103 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PrxO55103 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PrxO55103 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PrxO55103 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PrxO55103 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PrxO55103 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PrxO55103 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrxO55103 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrxO55103 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrxO55103 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrxO55103 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrxO55103 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PrxO55103 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrxO55103 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrxO55103 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrxO55103 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrxO55103 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrxO55103 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms