Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nck2O55033 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nck2O55033 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nck2O55033 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nck2O55033 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms