Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc3O55013 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc3O55013 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3O55013 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms