Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LatO54957 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LatO54957 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LatO54957 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LatO54957 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LatO54957 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LatO54957 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LatO54957 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LatO54957 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LatO54957 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LatO54957 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LatO54957 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LatO54957 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LatO54957 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LatO54957 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LatO54957 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LatO54957 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LatO54957 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LatO54957 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LatO54957 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LatO54957 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LatO54957 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LatO54957 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LatO54957 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LatO54957 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LatO54957 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LatO54957 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LatO54957 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LatO54957 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LatO54957 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LatO54957 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LatO54957 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LatO54957 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LatO54957 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LatO54957 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LatO54957 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LatO54957 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LatO54957 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LatO54957 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LatO54957 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LatO54957 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LatO54957 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LatO54957 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LatO54957 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LatO54957 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LatO54957 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LatO54957 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LatO54957 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LatO54957 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LatO54957 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LatO54957 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LatO54957 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LatO54957 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LatO54957 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LatO54957 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LatO54957 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms