Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NfkbieO54910 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbieO54910 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfkbieO54910 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms