Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16O54909 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16O54909 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16O54909 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16O54909 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16O54909 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16O54909 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16O54909 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms