Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr6O54689 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms