Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc4O35988 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc4O35988 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc4O35988 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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